Histopathology data for Eef1d

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #2 Thymus [MA:0000142]
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #3 Sternum [MA:0001331]
HET F #4 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Lymph node [MA:0000139]
HET F #2 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Liver [MA:0000358]
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #3 Spleen [MA:0000141] 1 0 Spleen: Extramedullary hematopoiesis, mild increase
HET F #2 Liver [MA:0000358]
HET M #1 Small intestine [MA:0000337]
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #2 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120]
HET M #3 Stomach [MA:0000353]
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Tibia [MA:0001361]
HET F #4 Esophagus [MA:0000352]
HET F #4 Eye [MA:0000261]
HET M #3 Large intestine [MA:0000333]
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #1 Thymus [MA:0000142]
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Testis [MA:0000411] 1 0 Testis: Mild increase in multinucleated giant cells
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #4 Skin [MA:0000151]
HET M #3 Tongue [MA:0000347]
HET M #3 Lung [MA:0000415]
HET F #4 Ear [MA:0000236]
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #4 Thyroid
HET M #3 Heart [MA:0000072]
HET M #3 Kidney [MA:0000368]
HET F #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #2 Knee joint [MA:0000471]
HET M #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #4 Lung [MA:0000415]
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #4 Stomach [MA:0000353]
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #3 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #4 Sternum [MA:0001331]
HET M #3 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #4 Heart [MA:0000072]
HET M #1 Bone [MA:0001459]
HET F #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #4 Liver [MA:0000358]
HET M #3 Brain [MA:0000168]
HET F #2 Tooth [MA:0000348]
HET M #3 Ear [MA:0000236]
HET F #2 Spleen [MA:0000141]
HET F #4 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #2 Eye [MA:0000261]
HET F #4 Tooth [MA:0000348]
HET F #4 Thymus [MA:0000142]
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #1 Kidney [MA:0000368]
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #2 Thyroid
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #3 Bone [MA:0001459]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139] 1 0 Lymph node, mesenteric: Mild, paracortical lymphoid hyperplasia
HET F #2 Sternum [MA:0001331]
HET F #2 Femur [MA:0001359]
HET F #2 Pancreas [MA:0000120]
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #3 Esophagus [MA:0000352]
HET F #4 Knee joint [MA:0000471]
HET M #1 Ear [MA:0000236]
HET F #2 Skin [MA:0000151]
HET M #1 Tongue [MA:0000347]
HET M #1 Heart [MA:0000072]
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #2 Uterus [MA:0000389] 2 0 Uterus: Moderate, stromal edema
HET M #1 Brain [MA:0000168]
HET M #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #2 Ear [MA:0000236]
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #3 Testis [MA:0000411]
HET F #2 Brain [MA:0000168]
HET F #2 Heart [MA:0000072]
HET M #1 Skin [MA:0000151]
HET F #2 Esophagus [MA:0000352]
HET M #3 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Esophagus [MA:0000352]
HET M #3 Knee joint [MA:0000471]
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #4 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Ovary [MA:0000384]
HET F #2 Lymph node [MA:0000139] 2 0 Lymph node, mesenteric: Moderate, paracortical and follicular lymphoid hyperplasia
HET M #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Spleen [MA:0000141]
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #2 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #2 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Large intestine [MA:0000333]
HET M #1 Eye [MA:0000261]
HET F #4 Spleen [MA:0000141]
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #2 Kidney [MA:0000368]
HET F #2 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #1 Thyroid
HET F #2 Tongue [MA:0000347]
HET F #4 Large intestine [MA:0000333]
HET M #3 Tibia [MA:0001361]
HET M #3 Liver [MA:0000358]
HET F #2 Ovary [MA:0000384]
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397]
HET M #1 Femur [MA:0001359]
HET F #2 Bone [MA:0001459]
HET F #4 Tongue [MA:0000347]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #3 Trachea [MA:0000441]
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Tooth [MA:0000348]
HET F #4 Kidney [MA:0000368]
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #3 Thyroid
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #4 Bone [MA:0001459]
HET F #2 Large intestine [MA:0000333]
HET M #3 Femur [MA:0001359]
HET M #3 Pancreas [MA:0000120]
HET F #4 Uterus [MA:0000389]
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #3 Skin [MA:0000151]
HET M #1 Knee joint [MA:0000471]
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #1 Trachea [MA:0000441]
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #3 Thymus [MA:0000142]
HET F #4 Brain [MA:0000168]
HET M #3 Eye [MA:0000261]
HET M #3 Epididymis [MA:0000397]
HET M #1 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #4 Small intestine [MA:0000337]
HET F #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter