Histopathology data for Katnip

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #1 Liver [MA:0000358]
HET F #1 Pancreas [MA:0000120]
HET M #3 Tooth [MA:0000348]
HET F #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #2 Heart [MA:0000072]
HET M #2 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Stomach [MA:0000353]
HET M #3 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Heart [MA:0000072]
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #3 Liver [MA:0000358]
HET M #3 Skin [MA:0000151]
HET M #3 Pancreas [MA:0000120]
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #1 Skin [MA:0000151]
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #4 Pancreas [MA:0000120]
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #2 Esophagus [MA:0000352]
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #4 Liver [MA:0000358]
HET M #3 Epididymis [MA:0000397]
HET F #1 Tooth [MA:0000348]
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #4 Tooth [MA:0000348]
HET M #3 Stomach [MA:0000353]
HET M #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #4 Eye [MA:0000261]
HET F #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Skin [MA:0000151]
HET M #2 Skin [MA:0000151]
HET F #1 Bone [MA:0001459]
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #2 Thyroid
HET F #4 Brain [MA:0000168]
HET F #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #2 Brain [MA:0000168]
HET M #2 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Small intestine [MA:0000337]
HET M #3 Bone [MA:0001459]
HET F #4 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Uterus [MA:0000389]
HET M #2 Lung [MA:0000415]
HET M #2 Tongue [MA:0000347]
HET M #2 Small intestine [MA:0000337]
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #1 Eye [MA:0000261]
HET M #2 Large intestine [MA:0000333]
HET M #2 Spleen [MA:0000141]
HET M #2 Kidney [MA:0000368]
HET F #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #4 Spleen [MA:0000141]
HET F #4 Large intestine [MA:0000333]
HET M #3 Eye [MA:0000261]
HET F #1 Heart [MA:0000072]
HET M #2 Pancreas [MA:0000120]
HET F #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #3 Heart [MA:0000072]
HET M #3 Esophagus [MA:0000352]
HET M #3 Sternum [MA:0001331]
HET M #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #2 Liver [MA:0000358]
HET F #1 Tibia [MA:0001361]
HET F #1 Esophagus [MA:0000352]
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #1 Sternum [MA:0001331]
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #2 Thymus [MA:0000142]
HET M #3 Tibia [MA:0001361]
HET F #1 Spleen [MA:0000141]
HET M #2 Knee joint [MA:0000471]
HET F #4 Knee joint [MA:0000471]
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #1 Kidney [MA:0000368]
HET M #3 Thyroid
HET M #3 Testis [MA:0000411]
HET F #4 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Ear [MA:0000236]
HET M #2 Trachea [MA:0000441]
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #4 Lymph node [MA:0000139]
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #2 Ear [MA:0000236]
HET F #1 Thyroid
HET M #3 Trachea [MA:0000441]
HET M #2 Sternum [MA:0001331]
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #1 Lymph node [MA:0000139]
HET M #3 Tongue [MA:0000347]
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #3 Lung [MA:0000415]
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #2 Bone [MA:0001459]
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #3 Knee joint [MA:0000471]
HET F #1 Trachea [MA:0000441]
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #3 Lymph node [MA:0000139]
HET F #1 Knee joint [MA:0000471]
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #1 Lung [MA:0000415]
HET F #4 Ovary [MA:0000384]
HET F #4 Thymus [MA:0000142]
HET M #3 Kidney [MA:0000368]
HET F #1 Tongue [MA:0000347]
HET M #3 Ear [MA:0000236]
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #2 Testis [MA:0000411]
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #4 Thyroid
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #4 Lung [MA:0000415]
HET F #1 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #4 Tongue [MA:0000347]
HET F #1 Ovary [MA:0000384]
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #4 Kidney [MA:0000368]
HET M #3 Thymus [MA:0000142]
HET F #4 Tibia [MA:0001361]
HET M #2 Tibia [MA:0001361]
HET F #1 Brain [MA:0000168]
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #1 Small intestine [MA:0000337]
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #3 Brain [MA:0000168]
HET F #4 Sternum [MA:0001331]
HET M #3 Small intestine [MA:0000337]
HET M #2 Epididymis [MA:0000397]
HET F #4 Esophagus [MA:0000352]
HET F #1 Uterus [MA:0000389]
HET F #4 Bone [MA:0001459]
HET F #1 Large intestine [MA:0000333]
HET M #3 Spleen [MA:0000141]
HET F #1 Ear [MA:0000236]
HET M #2 Tooth [MA:0000348]
HET F #1 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #3 Large intestine [MA:0000333]
HET M #2 Eye [MA:0000261]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter